祖師廟創建于清乾隆34（1769）年，在道光13（1833）年時因地震損毀而重建。到1895年時又慘遭日軍焚毀，四年后（1899）在地方士紳籌畫下二度重建。第三次則在臺灣光復后，由藝術家李梅樹先生主導設計規劃，他主張祖師廟該成為一座融合中國歷史、文化和寺廟藝術的廟宇，同時因其本身的西畫素養，使祖師廟又加入了西洋美術的色彩里供奉的是清水祖師。其生平眾說紛紜，各廟記載不一，若依三峽祖師廟的說法則是：祖師本名陳昭應，為北宋開封府人，因功受封并在福建省安溪縣清水巖建立祠堂，并隱居于清水巖，故稱清水祖師，安溪人則稱其祠為祖師廟。



位于三峽街區中心的三峽祖師廟是安溪移民的信仰中心，清水祖師又稱為祖師公、烏面祖師、落鼻祖師等，相傳是因為祂的神跡和法力的不同而有不同的稱呼，為相當普遍的民間信仰。三峽祖師廟原名長福巖，是享譽全臺的廟宇，創建于清乾隆34年(西元1769年)，至今已有二百多年的歷史，奉祀的是清水祖師，與萬華龍山寺、大龍峒保安宮并稱北市三大寺廟。

 

后來安溪人遷移來臺，為求神佛庇佑，于是帶著清水祖師一同前來，并定居于三峽。由于清水祖師顯赫靈驗，多年來祖師廟一直是三峽信仰與社會活動的重心，其在建筑、雕刻、繪畫上的表現，是臺灣廟宇中的經典之??作。
 

 

整座祖師廟乃是以木為頂、以石為基的建筑，采五門三殿式的格局，廟頂層層疊疊，每根脊上都有富麗堂皇的裝飾，廟內則無處不雕、無處不琢。其中最精彩的是廟中的石雕、石刻，不論就技巧與手法分析，都是民間藝術之最，其師傅中不乏已列國寶級之人物。

 

 

三峽祖師廟精致繁復的石雕、木雕和銅塑是祖師廟最大特色，此外，廟內多達百余根的柱子，也為全臺廟宇之冠。這些梁柱使用的石材均為本地產的觀音石，與傳統廟柱造形多不相同，有龍柱、花鳥柱及刻上對聯之圓柱，顯得豐富而多樣。祖師廟內所有的藝術雕刻工程，不論石柱或浮雕，都是由當時的三峽鎮長、也是著名畫家李梅樹領導規劃，這些作品迄今超過35年，依舊洋溢著濃厚的藝術氣息，令人贊嘆。